崎頂車站－patlabor的火車格納庫

縱貫線香山至中港（今竹南鎮）段於明治35年（清光緒28年，西元1902年）8月10日通車時並沒有經過崎頂庄（現竹南鎮崎頂里），而是通過大埔庄（今竹南鎮大埔里），沿著今日省13線（今香山內湖路起至竹南公義路）建築。這條路線較為直接，但中間需穿越坡度較陡的尖筆山，因此當大正15年（民國15年，西元1926年）提出縱貫線雙軌化計畫後，這個路段也進行改線工程，至遲於昭和3年（民國17年，西元1928年）完成改線。

由跨站天橋上俯瞰崎頂站。原崎頂號誌站的大約位置即為前方轉彎處，車站中央的通過線痕跡仍在

由於香山與竹南的距離較長，因此在現已廢棄的崎頂二號隧道外設置崎頂信號場（號誌站）（約今日崎頂站北方約250公尺處）。根據當時台灣總督府職員錄登記，崎頂信號場還有驛長，給薪比一些停車場（車站）的驛長還高。昭和6年（民國20年，西元1931年）香山至竹南站雙軌化完成，崎頂信號場也於10月1日升格為停車場，並增建一座木造站房，但只辦理客運，不辦理貨運業務。至於崎頂信號站並沒有因為崎頂站的設置而廢除，因為崎頂站兼有待避功能，為控制車站中央的通過線而繼續使用，一直到民國70年代通過線被拆除後才廢止。

崎頂站。遮雨蓬即為原木造站房位置，內有IC卡查驗裝置

崎頂站也是個倒下台階的車站，因為車站位置位於路面之下

崎頂站旁的觀景台，題有「老衢觀海」。崎頂在清乾隆時期原名老衢崎，是由平埔族中港社原住民所駐守的隘口，清代設省後此地設立崎頂庄。在19世紀中葉以前此地其實是臨海高地，所以當時從香山到竹南的官道是穿越尖筆山而行，這也是何以縱貫線香山到竹南段在早期會走尖筆山線。但到日本人占領台灣之後因為泥沙淤積的關係此地離海已經有段距離了，這是後來可以改線的基礎。

順帶一提，維基條文裡關於崎頂站的歷史部份有些是錯的（那個當然也是抄的啦，只是抄的網頁本身就有錯誤），崎頂一、二號隧道是為了改線工程才貫通建成，一直使用到民國67年電氣化完成後才廢除，昭和3年改線時廢除的是舊線的尖筆山隧道（現已消失）。有趣的是日據時代的台灣地圖裡，這段舊線一直沒有被槓掉，一直到1944年的地圖中才用改正的方式把新線加上去（舊線還在，只是用「╳」表示廢置）。

崎頂站旁的鋼筋水泥建物，應為原三等站時期的繼電室

崎頂站的月台其實很長，當年往來台中-台北時對此站的印象倒不是木造站房，而是這幾個大字與第二月台的候車室

本站光復後改為三等站，雖以行車業務為主，但由於日據時代即已開業的崎頂海水浴場就在車站外不遠處，因此為服務旅客，本站在夏季時會有特定班次的高級列車停靠。不過由於平時固定利用本站的旅客有限，到民國70年5月1日時本站降為有人號誌站，由竹南站管理。82年3月15日降為簡易站，83年12月1日再降為招呼站，因此也成為縱貫線北段（基隆－竹南）中唯一一個招呼站。但一直到民國88年為止，夏季時段仍有復興號與莒光號增停，以方便前往海水浴場之旅客，因此在增停期間仍由竹南站派員前往售票。

崎頂站第二月台的候車室，目前前往崎頂新樂園（即原崎頂海水浴場）的出入口即從掛有「第二月台」處的後方

崎頂站第二月台的候車室內部，原售票處已拆除

本站擁有岸式月台兩座，日據時代所建造的木造站房於降為招呼站後一併拆除，目前於站房原址搭了一個鋼架塑膠蓬聊遮風雨，一旁還有一座鋼筋水泥的公共廁所。在第二月台倒是有一座鋼筋水泥的候車室，何時興建的已不可考了，至少在降為簡易站前就已經存在。這個候車室原也兼附售票功能，設有一個售票間。但當崎頂海水浴場歇業，高級列車不再停靠後，這個售票間也被拆除。通往崎頂海水浴場的出口也在此候車亭後方，其實也就是把原有的鐵路圍籬拆去一段罷了。